一个加密的java程序。从C#转换过来的。很多无法解析有关问题

public class ElGamal
{
	private static final int MAXINT64LEN = sizeof(long); //用来作为读取的单位长度
	private static final String tempPrePadding = "_elgpad"; //用来生成paded文件的文件名
	private static final String tempPreTransforming = "_elgtrans"; //用来生成transformed文件的文件名
	private static final int BITSLEN = 60; //密钥的长度
	private RandomPrimeGenerator r = new RandomPrimeGenerator(); //用来生成随机数，及进行其他运算

	private long p; //大素数
	private long a; //生成元
	private long sk; //私钥
	private long pk; //公钥

	public ElGamal(long p, long sk)
	{
		this.p = p;
		this.sk = sk;

	}

	public final void init4Encode(long a)
	{
		this.a = a;
		this.pk = r.modPower(a, sk, p);
	}

	//将输入的文件进行变换之后，再加密，输出到输出文件中
	public final void Encode(String inputFile, String outputFile)
	{
		String path = Path.GetDirectoryName(inputFile);
		String name = Path.GetFileName(inputFile);
		String transformedFile = path + "\\"+tempPreTransforming + name;
		prepare4Encoding(inputFile, transformedFile, p);
		ElGamalEncode(transformedFile, outputFile);
		File.Delete(transformedFile);
	}
	//将输入的文件进行变换之后，再解密，输出到输出文件中
	public final void Decode(String inputFile, String outputFile)
	{
		String path = Path.GetDirectoryName(inputFile);
		String name = Path.GetFileName(inputFile);
		String decodedFile = path +"\\"+ tempPrePadding+name;
		ElGamalDecode(inputFile, decodedFile);
		postDecoding(decodedFile, outputFile, p);
		File.Delete(decodedFile);
	}
	//对于已经经过变换之后的文件，直接进行加密
	private void ElGamalEncode(String inputFile, String outputFile)
	{
		FileStream finput = openFile(inputFile);
		if (finput == null)
		{
			return;
		}
		FileStream foutput = createFile(outputFile);
		if (foutput == null)
		{
			return;
		}

		long m;
		while ((m = inputInt64(finput)) != -1)
		{
			long k = r.nextInt64(0, p - 1);
			long y1 = r.modPower(a, k, p);
			byte[] temp = BitConverter.GetBytes(y1);
			foutput.Write(temp, 0, MAXINT64LEN);
			long pk1 = r.modPower(pk, k, p);
			long y2 = r.multiplyMod(m, pk1, p);
			foutput.Write(BitConverter.GetBytes(y2), 0, MAXINT64LEN);
		}
		finput.Close();
		foutput.Close();
	}

	//将变换之后的文件进行直接解密
	private void ElGamalDecode(String inputFile, String outputFile)
	{
		FileStream finput = openFile(inputFile);
		if (finput == null)
		{
			return;
		}
		FileStream foutput = createFile(outputFile);
		if (foutput == null)
		{
			return;
		}
		long y1;
		while ((y1 = inputInt64(finput)) != -1)
		{
			long y2 = inputInt64(finput);
			long t = r.modPower(y1, sk, p);
			t = r.reverse(t, p);