问题总结：
1.重新导入的项目结构与原来的不同
src包等等都和原来的不同，打开项目主目录，中有个.classpath文件，用记事本打开会发现有一行<classpathentry kind="src" path="src"/>，估计它的意思就是说你的源文件位置，看看有没有这一行，没有一定要补上，
?
2.刷新项目不自动编译，将WEB-INF下面的classes文件夹中的字节码文件删除后不再重新生成
遇到此问题要检查是否有这一行
<classpathentry kind="output" path="web/WEB-INF/classes"/>
这是指定将字节码文件输出到哪，如果没指定当然不会默认给你找个地方存了。
3.以上两个步骤都做完了，但项目依旧跑不起来
这个时候你要用到MyEclipse的项目清理功能，在菜单栏里的project里有个clean，它会强制清除那些配置文件，重新生成就会正确了。
项目跑起来了，要记得做个笔记，以后遇到问题了有个参照！肯能解释的并不正确，但问题确实解决了！