MD5签名的有关问题

MD5签名的问题。
我要对文件进行MD5签名，我现在用的是fis = new FileInputStream(file)，然后直接read()方法进行了MD5加密。代码如下：
            fis = new FileInputStream(file);
    byte[] buffer = new byte[1024];
    int numRead = 0;
    while ((numRead = fis.read(buffer)) > 0) {
     messagedigest.update(buffer, 0, numRead);
    }
    fis.close();
我想问下我想对其编码格式指定成GBK的获取字节数组，如何做呢？如果不指定，是以什么编码格式读的字节数组呢？我指定了GBK为什么和不指定GBK获得的MD5不一样。
------解决方案--------------------
numRead = fis.read(buffer)---读不会管你原始文件里面是什么编码格式的，读出来都是二进制

MD5加密也不会管GBK中文还是非中文编码，直接二进制加密，你read出来的原始数据如果是默认的ISO8859-1，你手工转成GBK，当然MD5加密后的数据会不一样，字符集都不同了