问题描述
我使用Bindiff计算了恶意软件文件之间的相似性，因此根据成对相似性比较建立了相似性矩阵。
我想使用scipy.cluster.hierarchy.linkage(y, method='single', metric='euclidean')对结果进行scipy.cluster.hierarchy.linkage(y, method='single', metric='euclidean') ，但是文档说y应该是压缩或冗余距离矩阵。
那么，我如何将相似度矩阵（NOT距离矩阵）转换为所需的格式？
在它提到y可以是距离矩阵的上三角形。
但我想指出Bindiff中的比较顺序会改变结果，因此similarity(file1,file2) != similarity(file2,file1)
那我怎么能克服这个问题呢？
1楼
您可以自己实现层次聚类！
有 。 您需要做的就是使用相似度而不是距离。
但是你会很快意识到，你需要使它成为两个距离的对称相似度，最小值，平均值，最大值，无论如何。