C#是指定开发语言？那么同一段代码能保证在Win32和WP下跑？WPF也必须要掌握吗？
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C#不是指定开发语言，只是用的人比较多而已!
WPF是必须的
Win32的API和WP的API不同，引用的类也不一样
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wp8.1很多和以前不一样了。
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WP8用的是WP Silverlight。
WP8.1有WP Silverlight和Windows Runtime两种。
WP Silverlight是为了向下兼容WP8和WP7.5的应用，可以用C#/VB和XAML；Windows Runtime可以Windows 8.1的应用通用，可以用C#/VB和XAML，C++和XAML，JS和HTML。
C#+XAML和桌面的WPF比较像但类库里很多又有区别，WPF里的一些功能（比如控件的一些效果）WP是没有的。（有人说Silverlight是WPF的子集，个人觉得有点道理但没有仔细考证。）
WP Silverlight与Windows Runtime也有一些区别，比如Silverlight里System.Windows命名空间的很多控件在Windows Runtime里在Windows.UI.Xaml命名空间。
总之，“同一段代码能保证在Win32和WP下跑”可能没那么容易实现；个人认为WPF可以不用完全掌握，但是遇到问题有时候找不到WP的资料也可以参考WPF的做法。
C++和JS的不太清楚。
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主要是对xaml的掌握，掌握wpf也就肯定会xaml。
如果不会wpf，直接学wp也没事。