这次遇到的问题是，编译原子性代码出错。
代码是《GPU高性能编程cuda实践》第9章的hist_gpu_gmem_atomics.cu和hist_gpu_shmem_atomics.cu。
这次还是用原有sdk带有makefile修改来编译。
出现
"/usr/local/cuda-5.5"/bin/nvcc-ccbin g++ -I../../../common/inc -m32-gencodearch=compute_10,code=sm_10 -gencode arch=compute_20,code=sm_20-gencode arch=compute_30,code=sm_30 -gencodearch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" -o exe.o -chist_gpu_shmem_atomics.cu
error:identifier "atomicAdd" is undefined
分析：书中提到，原子性操作在低端的计算能力GPU是不支持的，
1.1以上的计算能力才支持全局内存的原子操作，
1.2以上的计算能力才支持共享内存的原子操作。
我观察到了makefile的nvvc的编译命令有-gencodearch=compute_10,code=sm_10，
感觉不靠谱，于是改了一下。
把
GENCODE_FLAGS := $(GENCODE_SM10) $(GENCODE_SM20) $(GENCODE_SM30)
改为
GENCODE_FLAGS := $(GENCODE_SM20) $(GENCODE_SM30)
#$(GENCODE_SM10)
就是把(GENCODE_SM10)选项去掉
再次编译,貌似没事。
运行，出问题了。输出不正常阿。
搞了很久，猜测一下，把GENCODE_SM10改为GENCODE_SM12就可以了。
makefile的主要修改如下
#CUDA code generation flags
ifneq($(OS_ARCH),armv7l)
GENCODE_SM12 := -gencode arch=compute_12,code=sm_12
endif
GENCODE_SM20 := -gencode arch=compute_20,code=sm_20
GENCODE_SM30 := -gencode arch=compute_30,code=sm_30 -gencodearch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\"
GENCODE_FLAGS := $(GENCODE_SM12) $(GENCODE_SM20) $(GENCODE_SM30)
我知道我机器GPU的Computecapability: 1.2，
所以这样改。但具体原因不知道。
目前只能这样理解：编译参数如果跟机器属性不符，有可能会出错。
不过还好，再次对cuda的编译有了更深入的理解。