MRPP（Multi ResponsePermutation Procedure）分析，类似于ANOSIM 分析，主要是用于分析高维度数据组间相似性的统计方法。
目的：用于评估两组实验数据的整体相似性，以及相似性是否显著。
执行：R中vegan包提供了MRPP分析的函数mrpp
结果：得到A值、P 值
A > 0，表示组间差异大于组内差异
A < 0，表示组内差异大于组间差异
P值评价组内差异与组间差异的显著性
### 输入文件的格式处理
>head(data)sp1 sp2 sp3 sp4 ... group
sample1 相对丰度... A
sample2 ... B
sample3 ... Alibrary(vegan)data.dist = vegdist(subset(data, select = -group)) ### bray Curtis 计算相似性矩阵
data.mrpp = mrpp(data.dist, grouping = data$group, permutations = 999) ### 得出A值、P值###
data.df = subset(data, select = -group)
data.mrpp = mrpp(data.df, grouping = data$group, permutations = 999, distance = "bray") ### data 是data.frame,指定distance 参数用于计算相似性矩阵的方法